UAGA se organiza geográficamente en seis comarcas:
- Agurain-Montaña Este
- Ariñez-Matauco
- Estribaciones-Aiara
- Rioja Alavesa –Montaña Oeste
- Treviño
- Valles Alaveses
Cada 8 años se celebra un Congreso, en el que participan todos los afiliados y afiliadas, para definir las líneas generales de acción sindical.
En el último Congreso que tuvo lugar en 2018, se aprobaron las líneas estratégicas para los próximos años, en los ámbitos de organización interna y de política agraria.
Cada año se celebra una Asamblea General, integrada por todas las explotaciones afiliadas, 1.059 en la actualidad. La Asamblea General es competente para tratar cualquier tema, pero específicamente:
- la elección del Comité Ejecutivo
- la modificación de estatutos
- la disolución del sindicato
- la aprobación de los presupuestos anuales
- la aprobación del cierre de cuentas anual
El Comité Ejecutivo es el órgano de gobierno de UAGA, encargado de asumir la dirección, el liderazgo y la acción sindical de la Unión, velando por su funcionamiento organizativo y reivindicativo. Es elegido en Asamblea General por cuatro años, pudiendo ser reelegido por otros cuatro años
Los miembros que componen el Comité Ejecutivo son:
Presidenta: Edurne Basterra Marquínez
Vicepresidente: Jon Moraza Ozaeta
Vocales: Nagore Ruiz de Zárate Cantal
Gorka Barredo Gómez
Jesús Bauza Nuin
Suplentes: Itxaso Compañón Arrieta
Iker Aguirre Astola
Asier Fernández de Jauregui Berrueta
La Junta Provincial es el órgano de representación de las comarcas y el foro de debate de todos los asuntos comarcales y sectoriales.
